Le secrétariat général se trouve à Yverdon (VD) et le secrétariat pour la Suisse alémanique à Liestal (BL).
L'équipe de Suisse Eole se compose de:
Lionel Perret, directeur de Suisse Eole
Secrétariat général, Yverdon (c/o Planair SA)
Reto Rigassi, responsable Suisse alémanique et chef de projet faune
Secrétariat Suisse alémanique, Liestal (c/o ENCO AG)
Yves Chevillat, chef de projet
Secrétariat général, Yverdon (c/o Planair SA)
Marie-Jeanne Tschudi, collaboratrice
Secrétariat général, Yverdon (c/o Planair SA)
Olivier Waldvogel, chef de projet
Secrétariat Suisse alémanique, Liestal (c/o ENCO AG)
Nicole Brodbeck, collaboratrice
Secrétariat Suisse alémanique, Liestal (c/o ENCO AG)